Проверить базы данных можно с помощью команды:

mysqlcheck -A

Оптимизировать все таблицы баз данных, можно командой:

mysqlcheck -o --all-databases

Команда для восстановления определенной базы данных:

mysqlcheck -r --databases BD

Оптимизация и ремонт всех таблиц во всех базах данных:

mysqlcheck --auto-repair -o --all-databases